在对马岛之魂中困难模式可以分为遭遇战、潜入、正面作战、探索、其它五个部分，遭遇战也就是走在路上遇到的蒙古巡逻队，这种战斗的最佳处理方式就是满级家传铠对峙五连，同时副手道具推荐黑火药弹和苦无，对峙结束后如果剩余敌人较多就扔炸弹，反之用苦无破防。

潜入可以使用多重暗杀、长弓、强化后的聆听、烟雾弹、风铃等辅助手段，首先使用风铃可以将敌人引到其它人的视野外暗杀避免尸体被发现，其次对大群敌人如果不想慢慢拆解还有一种方法，找到一个能跳杀的制高点扔鞭炮聚拢敌人然后三重暗杀，此时扔烟雾弹又可以进行多重暗杀，之后可以选择开战鬼架势或者扔第二个烟雾弹，最后如果能让营地中只剩下包括将领在内的三个敌人可以尝试回到正门进行对峙，可以秒杀将领。

正面作战道具流的难度远低于常规近战，l2武器中黑火药弹可以群体杀伤并造成特殊处决，爆炸箭伤害较低，但是补给较多，毒药也可以用来在正面作战时远程秒杀。r1武器中苦无用于破坏防御或者直接杀伤，粘性弹升满级后类似于黑火药弹，烟雾弹升级后可以用于强制暗杀，有时可触发多重暗杀，收益更高。火附牙则可以让普通攻击能无视防御，除此之外也有一些特殊近战招式比较好用，怒之舞和天之一刀比较适合应对已经敌对的敌人，磐石突刺三连和满级疾风踢适合应对正在攻击盟友的敌人，后者可以造成特殊处决。