游戏里除了最后一个章节之外，其他的章节都是存在隐藏地区，和隐藏boss等着玩家探索，玩家能通过与NPC的对话，和道具的详情去发现其中的线索，不过并不是所有的支线与任务，都是在同一章节或者一个章节就能完成的。比如在开局入口处，玩家就会遇到一只猴子，初见时可以看到它在打量着一个佛头，与之靠近它就会快速跑开，这时玩家就可以前往互动佛头，能够获取到“色蕴”道具。

“色蕴”道具在游戏里共有5个，其他四个分布在后续章节中，整体上可以说是贯穿游戏全程，需要陆续收集才能获得奖励的，“五蕴丹”作为完成此支线的奖励，使用后能增强诸多属性。而与之相对的就是完成当前章节，就可以结束的支线流程。这些隐藏机制往往都是和妖王BOSS有着非常大的关联，在一周目就想体验到更多隐藏玩法的玩家，推荐在遇到任何与剧情相关人物时，都尽可能的进行探索解析，以免到章节结束支线无法完成，这样就只能等到二周目重新挑战了。

当然游戏内单靠自己盲目寻找是非常耗费精力时的，喜欢收集的玩家可以通过游记中的影神图搭配探索，该图集会跟随游戏章节的推进同步更新，不光对探索收集有一定的辅助作用，也可以直接了解各个头目与妖王的精彩往事。一般来说隐藏地区和隐藏boss能得到的奖励都是非常丰厚，不追求速通的玩家可以慢慢探索，更好的了解“黑神话”的世界。